パソコンを使っている上で、ファイルは必ず使います。
メディアも色々で、USBメモリを使ったり外付けハードディスクを使ったりします。
新品のハードディスクを買ってくると、Windows用にNTFSでフォーマットされていたりしますが使い古しのものを使ったりする時 は一度フォーマットしたりします
ざっくりいうと以下の感じかなと思います。
Windows用ハードディスク : NTFS
WindowsとMacの間等でUSBメモリを使ってファイルをやり取りする場合 : FAT32もしくはexFAT
Linux : ext2/ext3/ext4
Linuxのファイルシステムはそれぞれに互換性が有ります
https://www.rescue-center.jp/explanation/filesystem/type.html
https://kazmax.zpp.jp/linux_beginner/mkfs.html